Zesilovač a promotér

Co je Enhancer?

Definice zesilovače:

Zesilovač je krátký kus nebo sekvence DNA, která zvyšuje nebo zrychluje rychlost genetické transkripce. Zesilovač se také často nazývá cis-regulační prvek a pohybuje se v rozmezí od 20 do 400 párů bází DNA.

Umístění:

Zesilovač může být umístěn buď upstream nebo downstream od určitého genu a může být ve stejné nebo odlišné orientaci ve srovnání s genem, který má být přepisován. Zesilovač nemusí být blízko místa začátku transkripce, aby fungoval. Zesilovače jsou přítomné a fungují jak v prokaryotických buňkách, tak v eukaryotických buňkách. Zesilovače mohou být nalezeny na intronech a exonech a mohou působit na geny jiného chromozomu.

Funkce:

Transkripční faktor se připojuje k zesilovači, který pomáhá stimulovat transkripci genu. Zesilovače ve skutečnosti nepůsobí přímo na promotory, ale nejprve musí být připojeny k transkripčním faktorům. Zesilovače mohou být tisíce bází od místa iniciace transkripce. To je možné kvůli tomu, jak zesilovače fungují. Transkripční faktory se nejprve vážou na zesilovač. Poté DNA ohybový protein přivádí zesilovač bližší k promotoru v procesu známém jako looping DNA. Zesilovače tak zvyšují nebo zrychlují rychlost transkripce tím, že přenášejí aktéry transkripce blíže k promotoru. Zesilovače mohou také regulovat více než jeden gen bez ohledu na jejich orientaci vzhledem k geny nebo geny. Zesilovače jsou také důležitým genetickým prvkem ve vývoji, protože mohou přispět ke zvýšení aktivace transkripce v buňkách.

Důležitost:

Některé zesilovače mohou hrát roli v lidských nemocech a výzkum naznačuje, že cis-regulátory mohou skutečně zvýšit riziko onemocnění, jako je diabetes typu 2, kardiovaskulární onemocnění a kolorektální karcinom.

Příklady zesilovače:

Příkladem zesilovače genu, který byl objeven, je HACNS1, o němž se předpokládá, že hrála roli ve vývoji palce člověka. Dalším příkladem zesilovače je proximální enhancer epiblastu (PEE), který je důležitým zesilovačem během vývoje těla obratlovců.

Co je organizátor?

Definice pořadatele:

Promotory jsou kusy sekvencí DNA, které ukazují, kde začíná transkripce DNA pomocí RNA polymerázy. Promotory se podílejí na zahájení nebo zahájení genetické transkripce, protože určují, který DNA řetězec bude přepisován (tj. Který řetězec je sense řetězec), a v jakém směru nastane transkripce.

Umístění:

Promotory se obvykle nacházejí před začátkem transkripce na 5 'konci místa, kde začne transkripce. Promotory musí být v poloze 5 'v blízkosti genu, který má být přepisován. 5 'konec DNA se vztahuje k řetězci DNA, který končí na 5'-uhlíku. Promotory se nacházejí jak v prokaryotických buňkách, tak v eukaryotických buňkách.

Funkce:

Promotory se váží jak na enzym RNA polymerázy, tak na transkripční faktory. Promotor iniciuje proces transkripce interakcí s RNA polymerázou a transkripčními faktory. RNA polymerázový enzym se slabě váže na sekvenci DNA a pohybuje se po řetězci, dokud nenarazí na promotor. V tomto stadiu pak vytvoří uzavřený promotorový komplex s promotorem. RNA polymeráza pak pokračuje k uvolnění DNA v iniciačním nebo počátečním místě transkripce za vzniku otevřeného promotorového komplexu. Potom se spustí přepis.

Důležitost:

Určité genetické promotory mohou být zahrnuty do onemocnění. Varianty promotorů mohou být spojeny s určitými onemocněními, jako je beta-talasémie a astma.

Příklady organizátorů:

Mnoho eukaryotických buněk má důležitou část promotoru známého jako TATA box, který lze nalézt od 25 do 35 bází před počátečním bodem transkripce. Bylo zjištěno několik příkladů promotorů. Některé z nich jsou důležité při vývoji rakoviny. Například promotor PEG-3 a lidská telomerasová reverzní transkriptáza (hTERT), které jsou oba nalezeny v rakovinových buňkách.

Rozdíl mezi Enhancer a Promoter?

1. Definice

Zesilovač je kus DNA, který zvyšuje transkripci genu. Promotor je kus DNA, který slouží k zahájení nebo zahájení genové transkripce.

1. Vázá se

Enhancer se váže s transkripčními faktory, zatímco promotor se váže s transkripčními faktory a enzymem RNA polymerázy.

1. Umístění

Zesilovač může být upstream nebo downstream od místa, kde je zahájena transkripce, zatímco promotor je vždy před místem, kde je iniciována transkripce.

1. Vzdálenost

Zesilovač nemusí být blízko místa, kde je zahájen transkripce, zatímco promotor musí být blízko místa, kde je iniciován transkripce.

1. Funkce

Zesilovač pracuje na zvýšení nebo zvýšení transkripce, zatímco promotér pracuje na iniciování procesu transkripce.

1. Důležitost

Zdá se, že enhancery jsou spojeny s onemocněními, jako je diabetes typu 2, kardiovaskulární onemocnění a kolorektální karcinom. Předpokládá se, že promotory jsou spojeny s onemocněními, jako je astma a beta-talasémie

1. Příklady

Příklady zesilovačů zahrnují HACNS1 a PEE. Příklady promotorů jsou promotor PEG-3 a reverzní transkriptáza pro lidskou telomerasu (hTERT).

Tabulka porovnávající Enhancer a Promoter

Shrnutí Enhancer Vs. Promotér

• Zesilovač je sekvence DNA, která slouží ke zvýšení transkripce.
• Promotor je sekvence DNA, která iniciuje proces transkripce.
• Promotor musí být blízko k genu, který je přepisován, zatímco zesilovač nemusí být blízko k požadovanému genu.
• Oba promotory a zesilovače pomáhají regulovat genetickou transkripci.
• Zvýšovače a promotory mohou být při onemocnění důležité.