Agaróza a polyakrylamid
Existují různé rozdíly týkající se agarózy a polyakrylamidu, včetně jejich fyzikální struktury, toxicity a způsobů jejich nalévání, jakož i jejich ceny. Je užitečné poznat tyto rozdíly, stejně jako jejich podobnosti, pokud jednáte s některým z těchto typů gelů.
Jedním z hlavních rozdílů mezi těmito dvěma gely je to, že se agaróza nalívá vodorovně, zatímco polyakrylamid se nalívá svisle. Je mnohem jednodušší nalít agarózu v tomto horizontálním způsobu. Agaróza může být vyhřívána, aby pomohla procesu nalévání, ačkoli by se neměla zahřívat v tak rozsáhlém měřítku, aby se agaróza nakonec roztavila. Dá se také rozhodnout, zda použít úzké nebo široké pruhy k nasycení agarózy. Lze jej nalít pomocí této metody drážkování a to je jedna z jejích výhod. Během nalévání by člověk měl být velice opatrný, protože agaróza je velmi jemná a může se snadno rozbít.
Na druhou stranu, jak bylo zmíněno, se polyakrylamid nalije vertikálně. Polyakrylamid potřebuje skleněné desky, které pomáhají s tímto procesem, protože jeho struktura je velmi tenká a tato dodatečná podpora je nezbytná. Na rozdíl od agarózy se polyakrylamid nemůže znovu ohřát a pak nalit.
Agaróza se skládá z mnoha molekul, zatímco polyakrylamid se obvykle skládá pouze z jedné velké molekuly. Molekuly agarózy jsou drženy společně intermolekulárními silami a molekuly jsou tvořeny DNA. Existují velké a malé molekuly a obecně jsou větší molekuly snadněji odděleny než menší. Molekula polyakrylamidu je tvořena DNA nebo proteinem. Mezery mezi gely polyakrylamidu jsou menší než mezery mezi gely agarózy, což je další rozdíl mezi těmito dvěma látkami. Tam, kde jsou velikosti pásů stejné v agaróze, existují různé rozměry pásů v polyakrylamidu. Pokud je molekula polyakrylamidu vystavena působení vzduchu, neztvrdne se rovnoměrně, protože vzduch zprošťuje polymerační proces.
Pokud jde o toxicitu, agaróza je považována za netoxickou látku. Zatímco polyakrylamid je považován za stejný, jeho prášek je považován za toxický a je moudré dokonce zpracovat gely s ochrannými opatřeními.
Polyakrylamid se používá pro sekvenování gelů a proteinových gelů. Jeho výhody spočívají v tom, že má snadné barvicí vlastnosti a může se vysušit za vzniku gelu. Kupuje se předem naliata a je méně nákladná než agaróza, přibližně za 5 dolarů na gel. (Agaróza je asi 1 dolar za gram). Doporučuje se, aby osoba měla dostatečné zkušenosti před zakoupením některého z těchto dvou gelů, stejně jako často požadovaný počet vzorků a požadovaná koncentrace gelu musí být známa před jakýmkoli zakoupením.
Souhrn:
1.Agaróza se nalije vodorovně, zatímco polyakrylamid se nalívá svisle. 2.Agaróza je dražší než polyakrylamid. 3.Agaróza se skládá z mnoha molekul, zatímco polyakrylamid se skládá pouze z jedné velké molekuly. 4. Na rozdíl od polyakrylamidu může být agaróza znovu zahřátá. 5.Agaróza je považována za netoxickou látku ve všech jejích formách, zatímco prášek z polyakrylamidu je považován za toxický.
