Endonukleázou a exonukleázou
Endonukleáza vs. exonukleáza
Endonukleáza a exonukleáza jsou enzymy nukleasy, které katalyzují hydrolýzu jednotlivých nukleotidů přítomných v řetězci DNA. Nukleázy hrají zásadní roli při analýze sekvence nukleotidů v DNA a RNA.
Exonukleáza Exonukleázové enzymy jsou kategorie enzymů, které se štěpí na nukleotidy na koncích molekuly DNA. Dvě vlákna DNA se navzájem doplňují. Jsou reprezentovány jako 3 'a 5' ramena. Fosfodiesterické můstky DNA a RNA jsou napadány dvěma třídami enzymů, které jsou reprezentovány jako "a" a "b". Enzymy skupiny "a" specificky hydrolyzují esterovou vazbu mezi 3 'uhlíkem a fosforečnou skupinou a enzymy ze skupiny "b" hydrolyzuje esterovou vazbu mezi 5 'uhlíkem a fosforečnou skupinou.
Dobrým příkladem skupiny "a" exonukleázového enzymu je jed jedoucího chřestýše a Russellova viperu. Tento jed se hydrolyzuje všechny 3 'vazby v DNA nebo RNA uvolňující nukleotidové jednotky jako nukleosidové 5' fosfáty. Enzymy třídy "b" jsou reprezentovány fosfodiesterázou sleziny, která hydrolyzuje všechny "b" nebo 5 'vazby jak DNA tak RNA, a tak uvolňuje pouze nukleosidové 3' fosfáty. Endonukleáza Enzymy endonukleázy jsou enzymy, které se štěpí na vazby DNA z molekuly. Na konci polynukleotidového řetězce nevyžadují volnou 3 'nebo 5' hydroxylovou skupinu. Endonukleázy postihují specifické 3 'nebo 5' vazby, ať se vyskytují v polynukleotidovém řetězci.
Endonukleázy jsou také zařazeny do skupin "a" a "b". Deoxyribonukleasa I bovinního pankreatu je rozdělena do třídy "a" enzymu katalyzující hydrolýzu některých 3 'vazeb DNA za vzniku oligonukleotidů obsahujících přibližně čtyři nukleotidové zbytky v průměru. Deoxyribonukleáza II je další endonukleáza třídy "b". Je izolována ze sleziny a thymusu různých bakterií a způsobuje hydrolýzu 5 'vazeb, která vede ke skupině nukleotidů. Souhrn: 1.Exonukleáza způsobuje hydrolýzu nukleotidu na koncích, kde je v polynukleotidovém řetězci přítomna volná 3 'nebo 5' hydroxylová skupina, zatímco exonukleáza nevyžaduje volnou 3 'nebo 5' hydroxylovou skupinu, která způsobí hydrolýzu polynukleotidového řetězce. 2.Exonukleasová aktivita je výsledkem nukleosidů, zatímco endonukleázová aktivita vede k oligonukleotidům. 3. Aktivita exonukleázy vede v malých jednotkách polynukleotidového řetězce téměř okamžitě, zatímco endonukleázová aktivita prochází lagální fází před uvolněním oligonukleotidových skupin. 4. Přítomnost exonukleáz je příčinou jedu a slezinné fosfodiesterázy, zatímco deoxyribonukleázy I a II jsou příklady endonukleáz.
